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開發者 卡爾斯魯厄理工學院Germany.gif
版本歷史 2007年11月13日
計算程序 WindowsLinuxMac OS X
子項目
項目平臺 BOINC 平臺
項目類別 生命科學
項目狀態 已結束
官方網址 [email protected]
項目文獻 分類:[email protected] 相關文獻
http://boinc.fzk.de/poem/rss_main.php 通過 RSS 獲取項目新聞


[email protected] 實現了一個理解蛋白質不同方面結構的重要的方法,并把它提供給世界性的分布式計算 . [email protected]背后的科學方法是讓 C. B. 安芬森獲得1972年諾貝爾化學獎的熱動力學假說的計算實現.

[email protected]是一個致力于提高我們對生物分子結構和功能認識的純學術,非盈利項目. 所有的結果都會發布在國際同行評審期刊上,并有對[email protected] 志愿者的適當注明.


如何加入項目

該項目基于 BOINC 平臺,簡要的加入步驟如下(已完成的步驟可直接跳過):

  1. 下載并安裝 BOINC 的客戶端軟件(官方下載頁面程序下載
  2. 點擊客戶端簡易視圖下的“Add Project”按鈕,或高級視圖下菜單中的“工具->加入項目”,將顯示向導對話框
  3. 點擊下一步后在項目列表中找到并單擊選中 [email protected] 項目(如未顯示該項目,則在編輯框中輸入項目網址:http://boinc.fzk.de/poem/ ),然后點擊下一步
  4. 輸入您可用的電子郵件地址,并設置您在該項目的登錄密碼(并非您的電子郵件密碼)
  5. 再次點擊下一步,如項目服務器工作正常(并且有適合自身操作系統的計算程序),即已成功加入項目

更詳細的加入方法說明,請訪問 BOINC 新手指南BOINC 使用教程

本站推薦您加入 Team China 團隊,請訪問項目官方網站的 團隊檢索頁面,搜索(Search)并進入 Team China 的團隊頁面,點擊頁面中的 Join 并輸入用戶登錄信息即可加入!

項目細節

本圖顯示了預測的(紅色)和實驗測得的(綠色)枯草芽孢桿菌主冷激蛋白結構. 這種蛋白質對實驗室條件下的基因調控非常重要.

蛋白質 是所有已知細胞生命的納米尺度機器. 令人震驚的是, 這些巨大的由多達100,000個原子組成的生物分子還折疊成了獨特的三維形狀來發揮它們的功能. 這些功能包括分子化學 (新陳代謝), 能量轉換 (光能到化學能的光合作用) 和傳輸 (氧氣運輸), 腦內信號處理 (神經元), 免疫反應 以及其他眾多方面, 而且通常有著任何人工過程無法企及的效率. 蛋白質功能失常往往與疾病相關,目前已經有數千種與疾病有關的蛋白質被鑒定出來,但很多還未確定結構. 為了理解,控制甚至是設計蛋白質我們需要研究蛋白質的結構, 而在實驗上比獲得一個特定蛋白質的化學成分 (蛋白質序列)更加困難。

通過加入本項目你將為以下研究計算:

  • 預測蛋白質的生物活性結構
  • 理解蛋白質相互交流的信號處理機理
  • 理解與蛋白質功能失常或蛋白質聚集相關的疾病
  • 在生物學上重要的蛋白質三維結構基礎上開發新藥物


[email protected] 實現了一個理解蛋白質不同方面結構的 重要方法, 并把它提供給世界性的分布式計算平臺. [email protected]背后的科學方法是讓 C. B. 安芬森 獲得1972年諾貝爾化學獎的 熱動力學假說的計算實現.

所以請幫助我們,加入[email protected], 解決上述科學謎團,破解隱藏在蛋白質未知結構中的生物信息.

[email protected]是一個致力于提高我們對生物分子結構和功能認識的純學術,非盈利項目. 所有的結果都會發布在國際同行評審期刊上,并有對[email protected]志愿者的適當注明.

關于得分

[email protected]一般來說在修改過app_info.xml或app_config.xml之后得分速度較快,重點是充分利用GPU,一般來說每128MB顯存即可運行一個工作單元,需要手動修改。請參見 中低端顯卡也能刷分——被人遺忘的POEM

相關鏈接

項目結束

親愛的 [email protected] 社區,

首先,我們想要對我們的項目每個貢獻者表達最深切地感謝。去年我們開發出一個GPU優化的SIMONA版本,被用作 [email protected]的一部分,不同程度地加速了計算。正因為計算加快了,我們很難再為我們的BOINC項目提供充足的工作(計算包)。

因此經過八年的運行,我們有這么多的計算力,我們不再需要你們慷慨的幫助來進行我們的科學研究。同時,其他較小和較大的項目比以往任何時候都需要更多的計算力。

GPU 加速的算法將會被開源,以便讓其他小組可以自行地自由使用高效的力場(?forcefield) 來利用GPU集群 (這的時限會到圣誕節。代碼已準備好發送,報告也寫好了,但還需要進行評審)。

我們對上個月的抽風表示抱歉;我們本來可以為最后的一些任務準備更好的運行。


再次感謝大家的支持,我們希望您的貢獻將從現在開始幫助其他的 BOINC 項目。我們要特別感謝 Vladimir Tankovich 在GPU代碼上所做的貢獻。

此致敬意,


[email protected] 團隊

P.S.︰ 我們將會持續開放一段時間論壇和網站。我們將在大約兩個月后逐漸清空隊列和關閉服務器進程。

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